【原 因】
受講者様が、コースマップに含まれているコースを、コースマップ経由ではなく、「見つける」、もしくは「最近受講したコース」経由で受講されている可能性があります。
管理者メニューの「コース」から、該当コースの公開設定が「全体公開」もしくは「条件に合致するユーザーに公開」になっているか、ご確認ください。
なっている場合、受講者様は、コースマップ経由だけではなく、「見つける」または「最近受講したコース」経由でも該当コースが受講可能な状態となっています。
この場合、コースマップを一度も開くことなく該当コースが受講出来てしまうため、表題のような状態となる可能性がございます。
【対 策】
該当ユーザー様に、今一度コースマップの画面を開いていただく(※)よう、お伝えください。
コースマップの進捗データは、コースマップ画面を開くごとに、更新されます。
コースマップが未完了となっている方も、再度コースマップ画面を開くことで進捗データを更新され、コースマップ完了となるかと存じます。

※ログイン後、ホームの「必須コースマップ」から該当のコースマップを選択いただくか、上部「コースマップ」から該当のコースマップを選択いただく等の操作で、コースマップ画面を開いていただければと存じます。
また、②の場合、その後の対策として、該当コースの公開設定を「非公開」にしていただくことで、該当コースをコースマップ経由でのみ、受講していただく設定とすることが可能です。